中国科大构建结构引导的RNA基础模型structRFM,提升结构与功能预测能力
中国科大MIRACLE实验室周少华教授、熊鹏特任研究员团队在《自然》在线发表结构引导的RNA基础模型structRFM,通过MUSES整合多来源二级结构预测,构建约2,100万条序列-二级结构配对数据,并设计结构引导的掩码语言建模策略。
中国科大MIRACLE实验室周少华教授、熊鹏特任研究员团队在《自然》在线发表结构引导的RNA基础模型structRFM,通过MUSES整合多来源二级结构预测,构建约2,100万条序列-二级结构配对数据,并设计结构引导的掩码语言建模策略。
京都大学、名古屋市立大学、名古屋大学的研究团队在网站「COMPASS」上公开了世界121个观测所100多年间以印画纸和微缩胶片保存的约140万枚地磁气模拟记录,可检索、放大与比较。
HZDR与TU Dresden团队在Nature Communications发表新计算方法XCP,通过计算原子间键强而非仅凭距离,预测任意晶体中最易剥离的晶面并判断能否形成稳定二维结构。
推荐理由:该方法把剥离判据从层间距离换成键强计算,读者可借此理解非层状晶体筛选思路的转变。
中国科学院古脊椎动物与古人类研究所卢静团队发布“数字鲨鱼图谱”,基于X射线计算机断层扫描数据对现生鲨鱼开展三维解剖重建,建立开放获取的数字解剖数据集,成果近日发表于《科学数据》。数据集收录117件鲨鱼标本,涵盖72个物种、25个科,覆盖现生鲨鱼全部9个目,其中115件完成全身三维重建、2件完成头部三维重建。该资源为鲨鱼比较解剖、功能形态学、生物力学、演化发育及仿生学研究提供系统的三维解剖数据。
中国科学院古脊椎所卢静团队近日发布“数字鲨鱼图谱”(Digital Shark Atlas),成果发表于《科学数据》(Scientific Data),并通过该所三维形态学数据库ADMorph向全球开放共享。
NASA Glenn Research Center 的研究团队开发了 JeNo、MGBK、V072、TFaNS、Linflux、BFANS、RSI、WOBBLE、MPT、ADPAC 等一系列航空发动机噪声预测与 CFD 软件,用于设计和分析新型推进系统。
JOREK 磁流体不稳定性模拟代码现已在 ITER IMAS 仓库向全球聚变科学界开放,开放许可将使更广泛的科学家群体参与贡献并用实验验证该代码。JOREK 是模拟磁流体等离子体不稳定性、托卡马克破裂及相关热与电磁载荷的参考代码,对 ITER 而言最重要的应用是研究和改进破裂缓解效率,可精确模拟碎弹丸注入物理及磁场三维演化,从而确定能量与粒子(包括逃逸电子)的沉积。
推荐理由:原文说明了JOREK的开源用途和对ITER破裂缓解研究的具体价值,便于读者判断其可复用性。
EUROfusion 宣布用于模拟聚变装置中大规模等离子体不稳定的软件 JOREK 开源,研究者可更便捷地获取和使用。JOREK 首行代码由 Guido Huijsmans 在二十多年前写就,长期用于模拟托卡马克与仿星器等离子体的多方面行为,其关于破裂和边缘不稳定性的研究结果正帮助设计 ITER 的破裂缓解系统。
推荐理由:文中说明了该代码二十余年的开发历程及其在托卡马克破裂与边缘不稳定性模拟中的用途,便于读者理解开源的实际分量。
IceCube Collaboration 发布公开数据集 IceTracks-DR2,涵盖2008-2022年共14年的中微子径迹事例观测,比此前发布的数据集延长四年,是迄今公开的 IceCube 中微子源搜索数据样本。
推荐理由:原文说明该数据集比上一版多四年并改进了探测器刻度与响应函数,读者可据此评估其对多信使研究的可用性。
IceCube 发布第二版径迹数据集 IceTracks-DR2,包含2008至2022年数据,用于中微子源搜索,是此前10年版本数据样本的升级。数据文件及说明可在 dataverse.harvard.edu 下载,相关问题可联系 analysis@icecube.wisc.edu。
推荐理由:该数据集覆盖2008至2022年径迹事例,读者可据此评估其对中微子源搜索的可用样本规模。